H ανάλυση των γενετικών δεικτών X-STR μπορεί να χρησιμοποιηθεί συμπληρωματικά των βασικών αναλύσεων ελέγχου της βιολογικής συγγένειας προκειμένου να ενισχύσει ένα αποτέλεσμα. H αρχική πληροφορία που πρέπει να γνωρίζουμε, ώστε να κατανοήσουμε τη συμβολή της ανάλυσης του Χ χρωμοσώματος σε υποθέσεις συγγένειας είναι οι εξής: Τα αρσενικά άτομα έχουν ένα Χ χρωμόσωμα, το οποίο μεταφέρουν αυτούσιο σε όλους τους θηλυκούς απογόνους, ενώ τα θηλυκά άτομα έχουν 2 Χ χρωμοσώματα καθένα από τα οποία μπορεί να μεταφερθεί τόσο στους θηλυκούς όσο και στους αρσενικούς απογόνους. Ωστόσο, για τα θηλυκά άτομα, η πληροφορία που μεταφέρεται από τη μητέρα σε κάθε απόγονο μπορεί να είναι λίγο ή περισσότερο διαφορετική, εξαιτίας ενός φαινομένου γενετικής φύσεως (ανασυνδυασμός). Πρακτικά τώρα, η συμβολή της ανάλυσης του Χ χρωμοσώματος είναι σημαντική σε πολλές υποθέσεις, όπως αυτές ενός βιασμού με υποψία αιμομιξίας και υποθέσεις πατρότητας στις οποίες δεν είναι διαθέσιμος ο υπό εξέταση πατέρας. Για παράδειγμα, η ανάλυση του Χ χρωμοσώματος αποδεικνύεται ένα ισχυρό εργαλείο σε υποθέσεις βιασμού ή ακόμη και εξακρίβωσης της πατρότητας που σχετίζονται με αιμομιξία, δηλαδή απαιτούν τον έλεγχο τον υπόπτων/συμμετεχόντων οι οποίοι έχουν μεταξύ τους σχέση πατέρα-γιού. Αυτό συμβαίνει διότι ο πατέρας με τον γιο έχουν κοινό το μισό γενετικό τους υλικό, αλλά δεν φέρουν το ίδιο Χ χρωμόσωμα. Το Χ χρωμόσωμα κληρονομείται από την εκάστοτε βιολογική μητέρα των υπόπτων/συμμετεχόντων και έτσι προσδίδει στην υπόθεση σημαντική πληροφορία σχετικά με την ταυτοποίησή τους. Επίσης, σε περιπτώσεις ελέγχου συγγένειας όπου ο πατέρας δεν είναι διαθέσιμος αλλά υπάρχει η μητέρα, μπορούμε να ανακτήσουμε την πληροφορία για το Χ χρωμόσωμα του πατέρα μέσω των βιολογικών τέκνων του. Η σημαντική παρατήρηση είναι ότι οι αδελφές με κοινό βιολογικό πατέρα θα έχουν ένα πανομοιότυπο Χ χρωμόσωμα. Η ισχυροποίηση της συμβολής αυτού του εργαλείου αφορά υποθέσεις, στις οποιές τα θηλυκά τέκνα έχουν διαφορετική βιολογική μητέρα. Οι αναλύσεις των εργαστηρίων της DNAlogy, για την περαιτέρω μελέτη μιας υπόθεσης βιολογικής συγγένειας, μπορούν να περιλαμβάνουν την ανάλυση 12 γενετικών δεικτών (STRs) του Χ χρωμοσώματος και να εφαρμόσουν την χρήση εξελιγμένων λογισμικών ανάλυσης, τα οποία λαμβάνουν υπόψη τους τις παραπάνω βασικές αρχές κληρονόμησης του Χ χρωμοσώματος.
